Hasta donde yo se, cada planeta va a su bola, aunque en algunos lugares hay microimperios, como puede ser el de ultramar, o federaciones de planetas proximos.
Gobernador imperial hay en cada planeta, pues todos los planetas, salvo los de los marines espaciales y los mechanicum tienen que pagar el diezmo imperial.
La economia imperial creo que va por creditos, sino recuerdo mal(puede que lo mezcle con Star wars XD). Aunque imagino que habra zonas donde se lleve el trueque o monedas alternativas.
El imperio es demasiado grande, y no se gobierna eficientemente, a pesar de que intenta ser centralista, lo cual, en algo tan basto es un problema.