Hombre, realmente habria que considerar los posibles recursos que haya en el planeta, los materiales que se encuentren bajo el manto de agua o incluso algo en plan "minerales unicos debido a la presion ejercida por la masa de agua". De hecho creo que en su momento hubo reglas un poco "de la casa" para partidas asi, donde las armas llegaban menos, las tropas podian mover mas, etc, etc.
Recordemos el Codex Lobos Espaciales, expulsan a los Tau de un planeta donde solo un 5% de la superficie esta encima del agua. Luego a base de Termis y Land Raiders destruyen sus bases submarinas